2006年

連盟（地区）日程球場代表校
北海道・東北５連盟
［北海道・札幌・北東北・仙台六・南東北］
 １０/３〜５ 札幌円山球場 東北福祉大
東京六大学野球連盟
 秋季リーグ戦優勝校 早稲田大
東都大学野球連盟
 秋季リーグ戦優勝校 亜細亜大
関東５連盟（２校）
［首都・神奈川・東京新・千葉県・関甲新］
 １０/３０〜１１/２ 横浜スタジアム 上武大
筑波大
北陸・東海３連盟
［愛知・東海地区・北陸］
１０/２７〜２９瑞穂球場愛知学院大
関西５連盟（２校）
［関西学生・関西六・阪神・近畿・京滋］
 １１/３〜６ 南港中央野球場 近畿大
大阪産業大
四国・中国３連盟
［広島六・中国・四国］
１０/２８、２９ 岡山県野球場 東亜大
九州３連盟
［九州六・福岡六・九州地区］
１０/２８、２９ 福岡ヤフードーム 九州産業大