2012年
| 連盟（地区） | 日程 | 球場 | 代表校 |
| 北海道代表（１校） [北海道学生・札幌学生] |
10月6日（土）〜8日（月） | 網走市・呼人球場 | 道都大学 |
| 東北地区代表（１校） [北東北大学・仙台六大学・南東北大学] |
10月26日（金）〜28日（日） | 開成山野球場 | 富士大学 |
| 東京六大学野球連盟 | 秋季リーグ戦優勝校 | 法政大学 | |
| 東都大学野球連盟 | 秋季リーグ戦優勝校 | 亜細亜大学 | |
| 関東地区代表（２校） [関甲新学生・千葉県大学・東京新大学 ・首都大学・神奈川大学] |
11月1日（木）〜４日（日） | 横浜スタジアム | 国際武道大学 桐蔭横浜大学 |
| 北陸・東海地区代表（１校） [東海地区大学・北陸大学・愛知大学] |
10月26日（金）〜28日（日） | 瑞穂球場 | 三重中京大学 |
| 関西地区代表（２校） [関西学生・関西六大学・近畿大学 ・阪神大学・京滋大学] |
11月1日（木）〜４日（日） | 南港中央野球場 | 大阪体育大学 京都学園大学 |
| 中国・四国地区代表（１校） [中国地区大学・四国地区大学・広島六大学] |
10月27日（土） | 倉敷マスカットスタジアム | 松山大学 |
| 九州地区代表（１校） [九州六大学・福岡六大学・九州地区大学] |
[予選トーナメント]10月19日（金）〜20日（土） | 福岡工業大学FITスタジアム | 福岡大学 |
| [決勝トーナメント]10月24日（水）〜26日（金） | 福岡Yahooドーム | ||